Ada 6 agenda RPJMD Kabupaten Fakfak 2016-2021, yang sifatnya umum dan khusus dikuti oleh kebijakan unggulan sebagai landasan pembangunan berbasis kampung.
1. Agenda Pembangunan Manusia yang Berkualitas menjadi bagian dari Revolusi Mental.
2. Agenda Peningkatan Produktivitas, Daya Saing Ekonomi dan Landasan Inovasi Daerah.
3. Agenda Peningkatan Tata Kelola Pemerintahan yang Efisien, Efektif dan Akuntabel.
4. Agenda Percepatan Pembangunan Infrastruktur dan Peningkatan Konektivitas Wilayah.
5. Agenda Peningkatan Peran Adat dan Budaya serta Afirmasi Action.
6. Agenda Pengelolaan Sumber Daya Alam yang Arif, Lestari dan Berkelanjutan.